fishandchips

Hier gibt's meinen heutigen Vortrag zum Thema Sequenzierung des menschlichen Erbguts und die Möglichkeiten der Personalisierten Medizin als PDF zum Download.

Nach der Bioinformatik fördert das BMBF nun die Systembiologie:

Der Forschungsansatz der Systembiologie zeichnet sich aus durch die arbeitsteilige Zusammenarbeit verschiedener Disziplinen, von den Ingenieurwissenschaften, der Informatik, Mathematik zur Chemie, Biologie und Medizin. Kern der systembiologischen Herangehensweise ist ein iterativer Prozess zwischen Laborexperiment und mathematischer Modellierung im Computer. Aufbauend auf großen Mengen quantitativer Daten werden mit Hilfe von Algorithmen Modelle erstellt, die es erlauben, Vorhersagen über das Verhalten komplexer biologischer Systeme zu machen mit dem Ziel eines Gesamtverständnisses des Systems.

Nur konsequent, dass auch wir unseren Studiengang Bioinformatik in diese Richtung umstrukturieren werden

Und in 10-20 Jahren kommt dann die Synthetische Biologie?

... nicht nur genomischer Daten: Circos, Integrative Genomics Viewer

Die Beilage BioMax und die Zeitschrift MaxPlanckForschung kann man kostenlos bei der Max-Planck-Gesellschaft bestellen

...auch das DKFZ (Deutsches Krebsforschungszentrum) bietet mit einblick kostenlose Informationen zu biomedizinischen Themen

...und auch die Fraunhofer-Gesellschaft bietet ein Magazin mit kostenlosem Wissen

...und für diejenigen, die sich für Pflanzengenetik interessieren gibt's GENOMXPRESS

...und noch mehr gibt's hier!

Das Laborjournal ist hingegen nur für Arbeitsgruppen kostenfrei, nicht für private Abonnenten.

Grad gefunden: die Leibniz-Gesellschaft hat natürlich auch ein eigenes kostenloses Journal.

Zum 10-jährigen Jubiläum des Studiengangs Bioinformatik an der FH Bingen heute mal ein Beitrag (letztes Thema in der Sendung "gut gelebt" vom 2.11.2010) bei gutenberg.tv

Excellent articles about programming in science in Nature today - a must read for all natural scientists:
• Computational science: ...Error
• Publish your computer code: it is good enough

Der wunde Punkt von Krebszellen, Technology Review vom 17.09.10:

Es ist Zeit, dass wir die Voll-Genom-Sequenzierung als Diagnosewerkzeug einsetzen, um ungewöhnliche Krebserkrankungen zu verstehen.

Wer erbt was?, DIE ZEIT vom 13.08.10:

Angesichts der verschlungenen Wege, auf denen das Erbgut die Körperfunktionen regelt, bleibt den Fachleuten als letzter Ausweg nur noch Forschung mit der Brechstange. Und dafür sind Megaprojekte notwendig, wie sie bereits in der Krebsforschung vorangetrieben werden: Die Entschlüsselung des kompletten Erbguts Hunderter Patienten soll bei jedem Volksleiden nun den Strauß entscheidender Gendefekte enttarnen.

Hawass et al.: Ancestry and Pathology in King Tutankhamun's Family

Wu et al.: An Automated Phylogenetic Tree-Based Small Subunit rRNA Taxonomy and Alignment Pipeline (STAP)

Hammer et al. (2010): mRNA-seq with agnostic splice site discovery for nervous system transcriptomics tested in chronic pain

EMBO (European Molecular Biology Organization) Portal: Jobs, Funding, Training

Eriksson et al. (2010): Web-Based, Participant-Driven Studies Yield Novel Genetic Associations for Common Traits (found via WissensLogs)

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Begrüßungs-Pop-Up auf http://gelbank.anl.gov/

• Sharp et al. (2010): Forces that influence the evolution of codon bias
• Prat et al. (2009): Codon usage is associated with the evolutionary age of genes in metazoan genomes
• Hershberg & Petrov (2008): Selection on Codon Bias
• Sharp et al. (2005): Variation in the strength of selected codon usage bias among bacteria

• Povolotskaya & Kondrashov (2010): Sequence space and the ongoing expansion of the protein universe

• Marwan: Amoeba-Inspired Network Design (leider nicht frei verfügbar)
• Costanzo et al.: The Genetic Landscape of a Cell (leider nicht frei verfügbar)
• Tero et al.: Rules for Biologically Inspired Adaptive Network Design (leider nicht frei verfügbar)
• FAZ: Netze, so weit das Auge reicht